Table 1 Published genomic regions/ QTLs associated with fiber quality and yield traits under drought stress in G. hirsutum
From: Multiomics approaches to explore drought tolerance in cotton
Traits | Chromosome location | Species | No. of QTLs | QTL identification model/analysis | Used marker system | References |
|---|---|---|---|---|---|---|
Boll size | A1, A6, A7, A9, D15, D17, D19, D22, D23, D24, D26 | G. hirsutum | 14 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Number of seeds /boll | A6, A7, A9, A10, A11, D16, D17, D19, D23, D24, D26 | G. hirsutum | 13 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Seed index | A5, A7, A8, A9, A10, A12, D15, D16, D17, D20, D21, D22, D23, D25, D26 | G. hirsutum | 16 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Lint index | A2, A4, A7, A8, A9, A9, A10, A11, A13, D14, D15, D15, D19, D20, D21, D23, D24, D25, D25, D26 | G. hirsutum | 22 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Lint percentage | A2, A8, A9, A10, A10, A11, A13, D14, D19, D21, D22, D23, D25 | G. hirsutum | 15 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber micronaire | A4, A5, A8, A9, A10, A13, D14, D16, D18, D19, D21, D22, D23, D24, D25 | G. hirsutum | 18 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber strength | A8, A10, D14, D15, D17, D18, D19, D21, D23, D24, D25 | G. hirsutum | 14 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber length | A3, A4, A8, A10, D14, D18, D19, D21, D23 | G. hirsutum | 13 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber uniformity | A7, A8, A10, A12, A13, D14, D15, D17, D18, D19, D20, D21, D24, D25 | G. hirsutum | 15 | Single-marker analysis | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Boll size | A9, D19, D22, D26 | G. hirsutum | 4 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Number of seeds /boll | A7, D26 | G. hirsutum | 3 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Seed index | D23 | G. hirsutum | 1 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Lint index | A2, A10, A13, D19 | G. hirsutum | 5 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Lint percentage | A10, A11, A13 | G. hirsutum | 8 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber micronair | A8, A10, D14 | G. hirsutum | 7 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber strength | A8, A10, D14, D18, D24 | G. hirsutum | 7 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber length | A8, A10, D14, D21 | G. hirsutum | 6 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |
Fiber uniformity | A10 | G. hirsutum | 2 | MQM QTL model | SNP | (Ulloa et al., 2020) |